早於50、60年代，香港的農業十分興旺，直至1998年內地菜無限量供港，面對價格低，產量多的內地菜，香港農友們的收入大受影響。加上80年代經濟發展迅速，不少農地荒廢。隨著大眾逐漸認識有機耕種，開始關注食物安全以及環保問題，漁農自然護理署於2000年推行有機耕作轉型計劃，鼓勵常規耕作的農友們轉型，改以有機方法種植。除此之外，亦希望此計劃能夠吸引更多人從事耕作，使土地復耕，使本地農業能夠持續發展。由於耕作模式轉變，初轉型的農友們都感到難以適應，因此菜聯社與漁護署於2004年成立了有機種植社群辦公室，以協助有機農友，為他們提供各種支援服務。

有機轉型區集中於新界北，包括吳家村、大江埔、坪輋及逢吉鄉，為方便支援農友，有機種植社群辦公室成立於元朗逢吉鄉，隨著有機農友數量增加，辦公室亦擴張遷往林村現址，以配合發展需要。